{"id":13267,"date":"2012-08-17T20:01:58","date_gmt":"2012-08-17T18:01:58","guid":{"rendered":"https:\/\/ocasapiens-dweb.blogautore.repubblica.it\/?p=13267"},"modified":"2021-09-21T18:14:33","modified_gmt":"2021-09-21T16:14:33","slug":"scritto-nel-dna","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/2012\/08\/17\/scritto-nel-dna\/","title":{"rendered":"Scritto nel Dna"},"content":{"rendered":"

Anticipato da Science Express<\/em>.
\n.
\nIl barbudo<\/a> George Church, Yuan Gao e Sriram Kozuri di Harvard descrivono<\/a> un nuovo sistema per registrare informazione in DNA di sintesi, un bit per base (A o C per zero e G o  T per uno – tipo codice a barre, stampato in 3-D) e per leggerla con un sequenziamento, visto che ogni anno i prezzi calano esponenzialmente di 6 volte per la materia prima e di 12 volte per sequenziarla, rispetto a 1,6  volte per l’elettronica.
\n.
\nRicetta:<\/p>\n

\n

We converted an html-coded draft of a book that included 53,426 words, 11 JPG images and 1 JavaScript program into a 5.27 megabit bitstream. We then encoded these bits onto 54,898 159nt oligonucleotides (oligos) each encoding a 96-bit data block (96nt), a 19-bit address specifying the location of the data block in the bit stream (19nt), and flanking 22nt common sequences for amplification and sequencing. …<\/p>\n

To read the encoded book, we amplified the library by limited-cycle PCR and then sequenced on a single lane of an Illumina HiSeq. We joined overlapping paired-end 100nt reads to reduce the effect of sequencing error. Then using only reads that gave the expected 115-nt length and perfect barcode sequences, we generated consensus at each base of each data block at an average of ~3000-fold coverage . All data blocks were recovered with a total of 10 bit errors out of 5.27 million.<\/p>\n<\/blockquote>\n

Aspettate a comprare un DNA-pad.<\/a> Non \u00e8 il prossimo Harry Potter, ma<\/p>\n

Regenesis: How Synthetic Biology Will Reinvent Nature and Ourselves <\/em> di G. Church ed E. Regis.<\/p><\/blockquote>\n

Regenesis: How Synthetic Biology Will Reinvent Nature and<\/div>\n
Ourselves<\/div>\n

Yeah…<\/p>\n

Su Science<\/em>
\nAltro paper da sommare a quello di Hansen et al<\/a>., con questo qui<\/a> e altri gi\u00e0 segnalati. James Anderson<\/a> di Harvard et al. hanno messo <\/a>insieme una serie di misure sull’aumento dell’umidit\u00e0 in quota e di esperimenti di fotochimica. Con il caldo estivo – per convezione, come ai Tropici – aumenta il vapore acqueo nella stratosfera statunitense.
\nIl vapore reagisce con i solfati, la reazione attiva il cloro che diventa un radicale libero di bucare l’ozono il quale essendo bucato fa passare pi\u00f9 UV i quali causano mutazioni del DNA. Per ora la concentrazione di vapore acqueo \u00e8 aumentata di poco e ci sono dati solo per la bassa stratosfera, per\u00f2<\/p>\n

\n

If currently increasing concentrations of CO2, CH4, and other infrared active gasses force the stratospheric system to a state of increasing water vapor concentrations, the impact on ozone is of considerable concern given the concentrations of chlorine and bromine in the stratosphere today.<\/span><\/p>\n<\/blockquote>\n

Da un lato,<\/span> l’Artico si squaglia e rischia di sgasare metano e CO2 a manetta, dall’altra rallentare il riscaldamento globale sparando solfati in atmosfera non sembra una buona idea.<\/span>.<\/span><\/p>\n

 <\/span><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Anticipato da Science Express. . Il barbudo George Church, Yuan Gao e Sriram Kozuri di Harvard descrivono un nuovo sistema per registrare informazione in DNA di sintesi, un bit per base (A o C per zero e G o  T per uno – tipo codice a barre, stampato in 3-D) e per leggerla con un sequenziamento,… Continua a leggere Scritto nel Dna<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[9,10,17,30],"tags":[2031,5116],"class_list":["post-13267","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-chimica","category-clima","category-genetica","category-tecno","tag-dna-storage","tag-ozono","entry"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/13267","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=13267"}],"version-history":[{"count":2,"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/13267\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":41008,"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/13267\/revisions\/41008"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=13267"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=13267"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=13267"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}