{"id":27307,"date":"2015-02-27T11:47:52","date_gmt":"2015-02-27T10:47:52","guid":{"rendered":"https:\/\/ocasapiens-dweb.blogautore.repubblica.it\/?p=27307"},"modified":"2021-10-16T19:32:04","modified_gmt":"2021-10-16T17:32:04","slug":"le-oche-3-amborella","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/2015\/02\/27\/le-oche-3-amborella\/","title":{"rendered":"Le Oche &#8211; 3 (Amborella, cont.)"},"content":{"rendered":"<p><em><img decoding=\"async\" class=\"aligncenter\" src=\"http:\/\/www.scientificamerican.com\/media\/inline\/blog\/Image\/Amborella-trichopoda.jpg\" alt=\"\" \/><\/em><br \/>\n<em>Cari orecchietti di radio pop,<\/em><br \/>\n<em>Le oche ricevono e volentieri pubblicano le spiegazioni di Giulio Valentino Dalla Riva che il <strong><a href=\"https:\/\/ocasapiens-dweb.blogautore.repubblica.it\/2015\/02\/12\/le-oche-3\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">giorno prima<\/a> <\/strong>di San Valentino ci aveva distrutto un mito (foto sopra). <\/em><\/p>\n<p>L&#8217;abominabile mistero di Darwin: da dove arrivano le piante da fiore? A cosa assomiglia la loro mamma? Quanti sessi contava? Quanto \u00e8 vecchia? Ma che domande per una signora!<\/p>\n<p>La questione, per cominciare, \u00e8 quella di individuare la radice dell&#8217;albero evolutivo delle Magnoliofite (o Angiosperme, per chi preferisce la nomenclatura di Lindl a quella di Cronquist, Takhttajan &amp; Max Zimmermann).<\/p>\n<p>Alla fine dello scorso millennio, una serie di analisi basate su un pugno di geni (Parkinson, Adams e Palmer 1999; Qiu et al. 1999; Soltis, Soltis e Chase 1999) assegna ad <em>Amborella trichopoda<\/em> l&#8217;eredit\u00e0 di un ramo evolutivo isolato da tutte le altre Angiosperme.\u00a0<em>Amborella<\/em> \u00e8 dunque una specie basale: &#8220;the most recent common ancestor&#8221; (l&#8217;antenato comune pi\u00f9 recente) di <em>Amborella<\/em> e una\u00a0qualsiasi altra\u00a0pianta da fiore sarebbe\u00a0la\u00a0mamma di tutte le\u00a0Angiosperme.<\/p>\n<p>Poco dopo altri studi (Barkman et al. 2000; Graham and Olmstead 2000) mostrano che per individuare quella radice con precisione occorre tener conto che alcuni loci genetici sono evoluti molto pi\u00f9 rapidamente di altri. La matematica diventa complessa, i modelli alternativi si moltiplicano.<\/p>\n<p>Protagonisti del dibattito, da pi\u00f9 di dieci anni, sono Vadim Goremykin [2] da una parte e Douglas e Pamela Soltis\u00a0[3] dall&#8217;altra. I &#8220;tedeschi&#8221;(Goremykin e compagni) e gli &#8220;yankee&#8221; (Soltis &amp; Soltis e compagni) se le danno di santa ragione. Complice,\u00a0mi raccontano voci di corridoio, l&#8217;inglese imperfetto di Goremykin. Il titolo orignale &#8220;<em>Amborella<\/em> Is Not <strong>a<\/strong> Basal Angiosperm&#8221; sarebbe stato meglio reso con &#8220;<em>Amborella<\/em> Is Not\u00a0<strong>the<\/strong> Basal Angiosperm&#8221;. Infatti, nelle analisi del gruppo di ricerca tedesco, un&#8217;altra manciata di piante contendono ad <em>Amborella<\/em> il primato.<\/p>\n<p>L&#8217;avvento della genomica non risolve la diatriba. Nel mentre la genetica delle piante \u00e8 entrata nella &#8220;big science&#8221;, attorno ad <em>Amborella<\/em>\u00a0si costituisce un consorzio ben finanziato e ben piazzato. Goremykin si trasferisce in Italia, alla\u00a0Fondazione Edmund Mach di San Michele all&#8217;Adige, e non demorde. Nel 2013 pubblica in Systematic Biology una rigorosa analisi filogenetica [4] che piazza una clade formata da <em>Trithuria,<\/em>\u00a0una Ninfeacea, e <em>Amborella<\/em> da una parte e tutte le piante fiorite dall&#8217;altra. Il consorzio di Soltis\u00a0&#8211; Soltis et al. risponde\u00a0[5] e la discussione non si placa [6], complice la povera storia famigliare di <em>Amborella<\/em>\u00a0che conta pochissimi parenti ancora in vita.<\/p>\n<p style=\"text-align: center;\">(<a href=\"http:\/\/www.nzpcn.org.nz\/flora_details.aspx?ID=128\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\"><em><strong>Trithuria inconspicua<\/strong><\/em><\/a> della Nuova Zelanda, dove sta Giulio&#8230;, l&#8217;oca s.)<\/p>\n<p>Forse \u00e8 presto per stabilire chi ha ragione e chi ha torto. La discussione si \u00e8 rivelata fruttuosa, e ha permesso di affrontare alcuni spinosi nodi metodologici. Io faccio il tifo per le Ninfee, piante acquatiche, con grandi fiori colorati. Altro che la modesta <em>Amborella<\/em>.<\/p>\n<p>[1] Endress, Peter K., The flowers in extant basal angiosperms and inferences on ancestral flowers.&#8221; <em>International Journal of Plant Sciences<\/em> 162, <a href=\"http:\/\/www.jstor.org\/stable\/10.1086\/321919\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">no. 5 (2001): 1111-1140<\/a>.<br \/>\n[2] Goremykin, Vadim V., Karen I. Hirsch-Ernst, Stefan W\u00f6lfl, and Frank H. Hellwig. &#8220;Analysis of the <em>Amborella<\/em> trichopoda chloroplast genome sequence suggests that <em>Amborella<\/em> is not a basal angiosperm.&#8221; <em>Molecular Biology and Evolution<\/em> 20, <a href=\"http:\/\/mbe.oxfordjournals.org\/content\/20\/9\/1499.abstract\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">no. 9 (2003): 1499-1505<\/a>.<br \/>\n[3] Soltis, Douglas E., and Pamela S. Soltis. &#8220;<em>Amborella<\/em> not a \u201cbasal angiosperm\u201d? Not so fast.&#8221; <em>American Journal of Botany<\/em> 91, <a href=\"http:\/\/www.amjbot.org\/content\/91\/6\/997.abstract\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">no. 6 (2004): 997-1001<\/a>.<br \/>\n[4] Goremykin, Vadim V., Svetlana V. Nikiforova, Patrick J. Biggs, Bojian Zhong, Peter Delange, William Martin, Stefan Woetzel, Robin A. Atherton, Patricia A. Mclenachan, and Peter J. Lockhart. &#8220;The evolutionary root of flowering plants.&#8221; <em>Systematic biology<\/em> 62, <a href=\"http:\/\/sysbio.oxfordjournals.org\/content\/62\/1\/50\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">no. 1 (2013): 50-61<\/a>.<br \/>\n[5] Drew, Bryan T., Brad R. Ruhfel, Stephen A. Smith, Michael J. Moore, Barbara G. Briggs, Matthew A. Gitzendanner, Pamela S. Soltis, and Douglas E. Soltis. &#8220;Another look at the root of the angiosperms reveals a familiar tale.&#8221; <em>Systematic Biology<\/em> (2014),<a href=\"http:\/\/sysbio.oxfordjournals.org\/content\/63\/3.toc\">\u00a0<\/a><a href=\"http:\/\/sysbio.oxfordjournals.org\/content\/63\/3\/368\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">63,\u00a0no. 3(2014):\u00a0368-382<\/a><br \/>\n[6] Xi, Zhenxiang, Liang Liu, Joshua S. Rest, and Charles C. Davis. &#8220;Coalescent versus concatenation methods and the placement of <em>Amborella<\/em> as sister to water lilies.&#8221; <em>Systematic Biology<\/em> 63, <a href=\"http:\/\/sysbio.oxfordjournals.org\/content\/63\/6\/919.abstract\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">no. 6 (2014): 919-932<\/a>.<br \/>\nWickett, Norman J., Siavash Mirarab, Nam Nguyen, Tandy Warnow, Eric Carpenter, Naim Matasci, Saravanaraj Ayyampalayam et al. &#8220;Phylotranscriptomic analysis of the origin and early diversification of land plants.&#8221; <em>Proceedings of the National Academy of Sciences<\/em> 111, <a href=\"http:\/\/www.pnas.org\/content\/111\/45\/E4859.full\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">no. 45 (2014): E4859-E4868<\/a>.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Cari orecchietti di radio pop, Le oche ricevono e volentieri pubblicano le spiegazioni di Giulio Valentino Dalla Riva che il giorno prima di San Valentino ci aveva distrutto un mito (foto sopra). L&#8217;abominabile mistero di Darwin: da dove arrivano le piante da fiore? A cosa assomiglia la loro mamma? Quanti sessi contava? Quanto \u00e8 vecchia?&hellip; <a class=\"more-link\" href=\"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/2015\/02\/27\/le-oche-3-amborella\/\">Continua a leggere <span class=\"screen-reader-text\">Le Oche &#8211; 3 (Amborella, cont.)<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[24],"tags":[377,455,2483,3086,5689],"class_list":["post-27307","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-ospiti","tag-amborella","tag-angiosperme","tag-evoluzione","tag-giulio-valentino-dalla-riva","tag-radio-popolare","entry"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/27307","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=27307"}],"version-history":[{"count":1,"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/27307\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":42919,"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/27307\/revisions\/42919"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=27307"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=27307"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=27307"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}