{"id":27391,"date":"2015-03-16T10:01:49","date_gmt":"2015-03-16T09:01:49","guid":{"rendered":"https:\/\/ocasapiens-dweb.blogautore.repubblica.it\/?p=27391"},"modified":"2021-11-13T19:39:47","modified_gmt":"2021-11-13T18:39:47","slug":"stranieri-nel-mio-genoma","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/2015\/03\/16\/stranieri-nel-mio-genoma\/","title":{"rendered":"Stranieri nel mio genoma"},"content":{"rendered":"<p style=\"text-align: left;\">Nei mitocondri, abbiamo il Dna di batteri, nel genoma una spolverata di geni di Neanderthal, denisovani e di una folla di antenati dalla cellula primigenia detta Luca in gi\u00f9. Da circa quindici anni, alcuni ricercatori dicono che nel frattempo siamo diventati ancora pi\u00f9 bastardi.<\/p>\n<p style=\"text-align: left;\">In open access su <em><strong><a href=\"http:\/\/genomebiology.com\/2015\/16\/1\/50\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Genome Biology<\/a><\/strong><\/em>, <a href=\"http:\/\/www.ceb.cam.ac.uk\/directory\/chiara-boschetti\/image_normal\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Chiara Boschetti<\/a> e quattro colleghi di Cambridge hanno cercato nel nostro trascrittoma (le sequenze di Rna corrispondenti ai geni attivi,\u00a0che trasmettono alla cellula le istruzioni per produrre una data proteina), e in quello di altre 9 specie di primati, 12 di <em>Drosophila<\/em>, 4 di <em>Caenorhabditis<\/em>\u00a0(pi\u00f9 14 vertebrati per verifica) quanti geni ogni gruppo aveva acquisito da batteri, muffe e alghe per <a href=\"http:\/\/it.wikipedia.org\/wiki\/Trasferimento_genico_orizzontale\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">trasferimento orizzontale<\/a>\u00a0(in ingl. HGT, o LGT per &#8220;laterale&#8221;) invece di ereditarli dai genitori.<\/p>\n<p style=\"text-align: left;\">Del trasbordo si occupano soprattutto i virus che usano il Dna nucleare dell&#8217;ospite, un batterio magari, per replicarsi e poi lo portano in altri ospiti.<\/p>\n<p style=\"text-align: left;\"><a href=\"http:\/\/www.sciencemag.org\/content\/292\/5523\/1903.long\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Jonathan Eisen et al.<\/a> avevano demolito\u00a0ricerche simili\u00a0nel 2001, ma non c&#8217;erano le banche dati di genomica, proteomica, trascrittomica e i mezzi di oggi. Di recente alcuni genetisti, ma non Eisen, avevano messo in discussione la presenza\u00a0<a href=\"http:\/\/journals.plos.org\/ploscompbiol\/article?id=10.1371\/journal.pcbi.1003107\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">di geni batterici<\/a> nelle cellule tumorali. La polemica riguarda soprattutto i primati, umani in particolare, nelle piante l&#8217;HGT mi sembra assodato.<\/p>\n<p style=\"text-align: left;\">Le baruffe precedenti spiegano le precauzioni prese da Chiara B. et al. per evitare errori e falsi positivi. <strong><a href=\"http:\/\/genomebiology.com\/2015\/16\/1\/50\/figure\/F1\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Risultato<\/a>:<\/strong><\/p>\n<p style=\"text-align: left;\"><em>Le specie di Drosophila, di Caenorhabditis e di primati hanno fino a centinaia di geni &#8220;stranieri&#8221;<\/em><\/p>\n<p style=\"text-align: left;\">In media i primati ne avrebbero 109, noi almeno 145 tra i quali 17 erano gi\u00e0 stati scoperti, e una cinquantina portati da virus.\u00a0Quelli con una funzione ben identificata sono legati al metabolismo e al sistema immunitario, per es. dai batteri ci siamo procurati il gene ABO per gli antigeni che corrispondono ai gruppi sanguigni e dai funghi i geni degli enzimi (sintasi) per l&#8217;acido ialuronico.<\/p>\n<p style=\"text-align: left;\"><em>Our analyses suggest that while fruit flies and nematodes have continued to acquire foreign genes throughout their evolution, humans and other primates have gained relatively few since their common ancestor. We also resolve the controversy surrounding previous evidence of HGT in humans and provide at least 33 new examples of horizontally acquired genes.<\/em><\/p>\n<p style=\"text-align: left;\">Rif. anche la <a href=\"http:\/\/news.sciencemag.org\/biology\/2015\/03\/humans-may-harbor-more-100-genes-other-organisms\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">notizia<\/a> su <em>Science<\/em>.\u00a0<a href=\"http:\/\/phylogenomics.blogspot.it\/2015\/03\/horizontal-gene-transfer-into-humans-i.html\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Jonathan Eisen<\/a> non \u00e8 convinto.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Nei mitocondri, abbiamo il Dna di batteri, nel genoma una spolverata di geni di Neanderthal, denisovani e di una folla di antenati dalla cellula primigenia detta Luca in gi\u00f9. Da circa quindici anni, alcuni ricercatori dicono che nel frattempo siamo diventati ancora pi\u00f9 bastardi. 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