{"id":32272,"date":"2017-07-20T17:45:11","date_gmt":"2017-07-20T15:45:11","guid":{"rendered":"https:\/\/ocasapiens-dweb.blogautore.repubblica.it\/?p=32272"},"modified":"2021-12-27T19:03:04","modified_gmt":"2021-12-27T18:03:04","slug":"la-ricerca-piu-bella-del-decennio","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/2017\/07\/20\/la-ricerca-piu-bella-del-decennio\/","title":{"rendered":"La ricerca pi\u00f9 bella del decennio"},"content":{"rendered":"

Esce <\/a><\/strong>su una rivista dell’editore Frontiers, ne parlo spesso male; estrae correlazioni da sequenziamenti di massa detti Genome Wide Association Studies\u00a0<\/a>sui quali leggo critiche un anno<\/a> s\u00ec e l’altro pure<\/a>; usa una valanga di statistiche e quando mai non ho da ridire…
\nBref, ero un tantino prevenuta.\u00a0Invece<\/p>\n

Genome Wide Association Study to Identify the Genetic Base of Smallholder Farmer Preferences of Durum Wheat Traits<\/a><\/strong><\/em><\/p>\n

(ri-link cos\u00ec cliccate, fain\u00e9ants) \u00e8 un capolavoro (non male anche il capitolo precedente<\/a><\/strong>, ma pi\u00f9 tecnico e condensato).<\/p>\n

Dall’introduzione ai ringraziamenti finali, riflette esattamente le intenzioni della ricerca, rispetta la dignit\u00e0 e l’intelligenza dei volontari\/partecipanti, \u00e8 attento alle piccole e grandi differenze culturali e sociali, al senso di giustizia che dovrebbe sottendere gli Scopi per lo sviluppo sostenibile, alla sicurezza alimentare dei pi\u00f9 poveri in tempo di cambiamenti climatici (nota 1), al contesto locale e globale (l’introduzione \u00e8 fantastica).<\/p>\n

\"\"<\/p>\n

Foto: Eat Globe<\/a> (?)<\/p>\n

\u00c8\u00a0uno scambio tra pari: da un lato le conoscenze accumulate nei secoli da 60 piccoli contadini etiopi sulle variet\u00e0 locali (land races) di Triticum turgidum <\/em>subs. durum,<\/em>\u00a0dall’altro quelle scientifiche di Matteo Dell’Acqua, un post-doc all’Istituto di Scienze della Vita<\/a><\/strong> della Scuola Superiore Sant’Anna, dei suoi dottorandi etiopi, di altri ricercatori della Sant’Anna, dell’universit\u00e0 di Bologna e di Bioversity International<\/a><\/strong>.<\/p>\n

Da un lato il breeding partecipativo: sono stati i contadini e le contadine a indicare le caratteristiche di cui hanno bisogno sugli altipiani dell’Amhara e del Tigray, a due diverse altitudini, e a valutare quante erano presenti nelle 400 variet\u00e0 di cui 28 “moderne”, che non avevano mai usato e che poi sono state coltivate. (La descrizione del protocollo per la valutazione \u00e8 emozionante: il voto \u00e8 espresso in semi, da 1 a 5, e di nascosto per evitare il group-think.)<\/p>\n

Dall’altro la potenza della genomica e della genetica quantitativa: sono stati i ricercatori e le ricercatrici ad identificare e correlare quelle caratteristiche a determinati geni, tenendo conto dei limiti dei vari “filtri” statistici (cosa posso chiedere di pi\u00f9?).<\/p>\n

The high heritability scored by FTs [Farmers’ Traits] suggests that smallholder farmers’ traditional knowledge may indeed be used to guide genetic gain through quantitative methods such as QTL [quantitative trait loci]\u00a0mapping, marker assisted selection, and genomic selection.<\/p>\n

[…]\u00a0\u00a0Our results show that it is feasible to involve farming communities to directly evaluate broad collections of genotypes using a selected set of summary traits previously agreed. In fact, during the 2016 growing season, with an effort requiring 2 weeks of field work, smallholder farmers from a third community in the Amhara region of Ethiopia evaluated 1,200 recombinant inbred lines we produced from the diversity panel here employed.<\/p>\n

Abbiamo solo iniziato a scavare, dicono gli autori, il frumento ha una marea di geni. E non abbiamo nemmeno tentato di valutarne la farina. S\u00ec, ma hanno creato un metodo per selezionare rapidamente le variet\u00e0 pi\u00f9 adatte per i piccoli contadini ai quali l’oligopolio delle sementi non pensa, e un precedente per ricerche analoghe – non solo sui cereali.<\/p>\n

Matteo Dell’Acqua<\/strong><\/a> – coordinatore anche del prossimo capitolo (la “stagione 2016”) – sembra aver studiato il durum<\/em> etiope con Stefano Bocchi, della Statale, che ne sa tutto o quasi.***<\/strong> Di sicuro conosce bene il lavoro di Salvatore Ceccarelli e Stefania Grando, all’ICARDA<\/a><\/strong>. Ieri ero cos\u00ec entusiasta che ho mandato loro il paper – e mi son dimenticata di dire che anche Matteo Dell’Acqua era stato premiato all’Expo 2015…<\/p>\n

***<\/strong> Sbagliavo: lo ha studiato con Mario Enrico P\u00e8<\/a>, ideatore del progetto. Scusi prof, e complimenti anche a lei.<\/p>\n

*<\/p>\n

(1) Ai lettori giovani, segnalo il paper di Jim Hansen e varie star, “Young people’s burden: requirement of negative CO2\u00a0emissions<\/a>“; e il quiz di Stefan Rahmstorf, “The climate has always changed, what do you conclude<\/a>?”<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Esce su una rivista dell’editore Frontiers, ne parlo spesso male; estrae correlazioni da sequenziamenti di massa detti Genome Wide Association Studies\u00a0sui quali leggo critiche un anno s\u00ec e l’altro pure; usa una valanga di statistiche e quando mai non ho da ridire… Bref, ero un tantino prevenuta.\u00a0Invece Genome Wide Association Study to Identify the Genetic… Continua a leggere La ricerca pi\u00f9 bella del decennio<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[10,17,23],"tags":[2443,2818,3231,4306,5646,6220,6306],"class_list":["post-32272","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-clima","category-genetica","category-non-profit","tag-etiopia","tag-frumento","tag-gwas","tag-matteo-dellacqua","tag-qtl-mapping","tag-scuola-superiore-santanna","tag-sicurezza-alimentare","entry"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/32272","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=32272"}],"version-history":[{"count":2,"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/32272\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":45031,"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/32272\/revisions\/45031"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=32272"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=32272"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=32272"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}