{"id":36141,"date":"2020-12-04T15:54:29","date_gmt":"2020-12-04T14:54:29","guid":{"rendered":"https:\/\/ocasapiens-dweb.blogautore.repubblica.it\/?p=36141"},"modified":"2022-04-24T16:59:26","modified_gmt":"2022-04-24T14:59:26","slug":"approccio-collaborativo","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/2020\/12\/04\/approccio-collaborativo\/","title":{"rendered":"&quot;Approccio collaborativo&quot;"},"content":{"rendered":"<p>Non avevo mai visto un articolo di virologia con tante firme, ben 10 &#8220;corresponding authors&#8221; e altri membri di un paio di consorzi, nascosti nei materiali supplementari. <strong><a href=\"https:\/\/science.sciencemag.org\/content\/370\/6521\/eabe9403\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Guardate qua<\/a><\/strong>, sembra quasi un paper di fisica delle particelle o di astrofisica delle onde gravitazionali!<br \/>Per <em>Science<\/em> \u00e8 anche un paper insolitamente lungo.<\/p>\n<p><strong><a href=\"https:\/\/science.sciencemag.org\/content\/370\/6521\/eabe9403\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">David Gordon<\/a><\/strong> (non corresponding author, tra l&#8217;altro) e a seguire centinaia di altri ricercatori in istituti europei &#8211; c&#8217;\u00e8 un <a href=\"https:\/\/www.uniba.it\/docenti\/berardi-francesco\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">farmacologo<\/a> dell&#8217;universit\u00e0 di Bari &#8211; e statunitensi, ma provenienti da tutto il mondo, &#8220;mappano&#8221; e confrontano le interazioni tra le proteine delle nostre cellule e quelle dei coronavirus della Sars, del Mers e del Covid-19. Sulla mappa identificano i meccanismi infettivi comuni a vari ceppi in circolazione.<br \/>Un lavoro pazzesco.<\/p>\n<p>Durante la malattia, i virus infettano cellule di tessuti diversi, nelle quali i geni esprimono altre proteine, la mappa cambia nel tempo:<\/p>\n<blockquote>\n<ul>\n<li><em>We also <strong>localized each individually-expressed viral protein<\/strong> by microscopy and then raised and validated antisera against 14 SARS-CoV-2 proteins to determine their localization during infection.<\/em><\/li>\n<\/ul>\n<\/blockquote>\n<p>Sono circa a met\u00e0 dell&#8217;opera.<\/p>\n<blockquote>\n<ul>\n<li><em>On the basis of two independent genetic perturbation screens, we identified 73 host factors that, when depleted, caused significant changes in SARS-CoV-2 replication. From this list of potential drug targets, we validated the biological and clinical relevance\u00a0<\/em>[degli anticorpi] <em>Tom70, IL17RA, PGES-2, and SigmaR1.\u00a0<\/em><\/li>\n<\/ul>\n<\/blockquote>\n<p>Hanno quasi finito. Resta da capire se quegli anticorpi sono rilevanti anche\u00a0<em>in vivo.<\/em><\/p>\n<blockquote>\n<ul>\n<li><em>we identified SARS-CoV-2 patients who were prescribed drugs against prioritized targets and asked how they fared compared with carefully matched patients treated with clinically similar drugs that do not inhibit SARS-CoV-2. Both indomethacin, an inhibitor of host factor PGES-2, and typical antipsychotics, selected for their interaction with sigma receptors, showed effectiveness against COVID-19 compared with celecoxib and atypical antipsychotics, respectively.<\/em><\/li>\n<\/ul>\n<\/blockquote>\n<p>Sembra strano, sono molecole pericolose, ma in maggio su <strong><a href=\"https:\/\/www.nature.com\/articles\/s41586-020-2286-9\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\"><em>Nature<\/em><\/a><\/strong>, David Gordon et al. elencavano alcuni antipsicotici tra una dozzina di farmaci che potevano essere &#8220;riposizionati&#8221; contro il Covid-19. Come gli autori di paper che ho adocchiato nel frattempo, insistevano sul fatto che hanno effetti collaterali pesanti e che non vanno prescritti in massa. Semmai in esperimenti clinici strettamente sorvegliati.<\/p>\n<p>Questa volta non lo ripetono, ma alla fine della &#8220;Discussion&#8221; scrivono che servir\u00e0 parecchio lavoro e studi su altre coorti di pazienti &#8220;per vedere se\u00a0c&#8217;\u00e8 un valore terapeutico in queste connessioni&#8221;.\u00a0Gran finale:<\/p>\n<blockquote>\n<ul>\n<li><em>We used proteomics, cell biology, virology, genetics, structural biology, biochemistry, and clinical and genomic information in an attempt to provide a holistic view of SARS-CoV-2 and other coronaviruses\u2019 interactions with infected host cells. We propose that such an integrative and collaborative approach could and should be used to study other infectious agents as well as other disease areas.<\/em><\/li>\n<\/ul>\n<\/blockquote>\n<p>Vengono in mente molte infezioni virali &#8211; e non &#8211; che avrebbero bisogno di un approccio cos\u00ec, ma c&#8217;\u00e8 una pagina intera solo per i finanziamenti che lo hanno reso possibile.\u00a0Se il covid non faceva centinaia di migliaia di vittime nei paesi ricchi, li trovavano?<\/p>\n<p style=\"text-align: center;\">*<\/p>\n<p>Su <em>Science<\/em>, e altrove, continua il dibattito sull&#8217;<strong><a href=\"https:\/\/science.sciencemag.org\/content\/early\/2020\/12\/02\/science.abf5084.full\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">etica dei trial <\/a><\/strong>con i vaccini anti-covid. Questa <strong><a href=\"https:\/\/www.nejm.org\/doi\/full\/10.1056\/NEJMp2033538?query=featured_home\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Perspective<\/a><\/strong> del <em>NEJM<\/em> spiega meglio &#8211; trovo &#8211; perch\u00e9 la somministrazione delle prime dosi disponibili faccia ancora parte dell&#8217;esperimento clinico di fase III e i risultati vanno confrontati con quelli di un gruppo placebo.<\/p>\n<blockquote>\n<ul>\n<li><em>This opportunity to obtain reliable evidence about longer-term effects would be destroyed by early unblinding and immediate vaccination of participants assigned to placebo. Although each participant has the option to pursue any available intervention, if substantial numbers of participants choose not to do so, continuation of blinded follow-up in a population in which no licensed vaccine is being deployed could yield important and unexpected findings that would be difficult to obtain reliably any other way.<\/em><\/li>\n<\/ul>\n<\/blockquote>\n<p>I partecipanti sono stati informati delle regole e le hanno accettate, \u00e8 vero. Anche se sono a rischio, non sono dei pazienti, vero anche questo. Ma se i vaccini sono davvero efficaci al 70-90%, non \u00e8 chiedere\u00a0 troppo?<br \/>Nel caso del vaccino anti-Ebola, l&#8217;efficacia era tale che tutti i partecipanti al gruppo placebo sono stati vaccinati.<\/p>\n<p><strong><a href=\"https:\/\/blogs.sciencemag.org\/pipeline\/archives\/2020\/12\/04\/get-ready-for-false-side-effects\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Derek Lowe<\/a><\/strong> ricorda, giustamente, che quando si vaccinano milioni di persone, ci sono per forza &#8220;eventi avversi&#8221; falsi.\u00a0Oggi esce un altro articolo imperdibile di Philip Ball per <em><strong><a href=\"https:\/\/www.prospectmagazine.co.uk\/magazine\/what-you-need-to-know-about-the-vaccine\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Prospect<\/a><\/strong><\/em>, sulla <strong><a href=\"https:\/\/www.nature.com\/articles\/nrd.2017.243\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">lunga ricerca<\/a><\/strong> di vaccini a mRna, &#8220;un\u00a0approccio sviluppato per anni e pronto giusto in tempo, ma non soltanto per un colpo di fortuna&#8221;.<\/p>\n<p style=\"text-align: center;\">***<\/p>\n<p><strong><a href=\"https:\/\/twitter.com\/i\/status\/1334522099378032640\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Per passanti occasionali<\/a><\/strong><\/p>\n<p>Ussign\u00f9r. Se invece del coronavirus attutito un vaccino anti-covid contiene un pezzettino del suo <strong>m<\/strong>Rna, <strong>non<\/strong> ci trasforma in un organismo geneticamente modificato. La\u00a0<strong>m<\/strong> sta per &#8220;messaggero&#8221;. Al macchinario cellulare (ribosomi) che produce le proteine, trasmette le istruzioni per costruire un antigene, per esempio la punta pericolosa della proteina S (Spike) che sta sulla corona.<br \/>La cellula trasforma il mRna nell&#8217;antigene, che\u00a0<strong>non<\/strong> entra nel nucleo dove ci sono i geni,\u00a0<strong>non<\/strong> ne modifica il Dna. E una proteina, non \u00e8 un virus intero.<br \/>L&#8217;antigene rilasciato dalla cellula \u00e8 un segnale d&#8217;allarme per le colleghe del sistema immunitario che si mettono a produrre anticorpi.\u00a0(h\/t A.-M. C.\u00a0<em>et al.<\/em>)<\/p>\n<p><strong>Aggiunto\u00a0<\/strong><strong>7\/12<\/strong><\/p>\n<p>Quando si dice &#8220;approccio collaborativo&#8221;&#8230; Nei commenti Paolo C. e Cimpy raccomandano la spiegazione meno sommaria di Matteo Ferrito, ripresa su <strong><a href=\"https:\/\/www.valigiablu.it\/false-informazioni-vaccini-social\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Valigia blu<\/a>.<br \/><\/strong><br \/>Ho\u00a0messo una citazione di Philip Ball e il link (m&#8217;ero dimenticata!) che dovevano esplicitare la &#8220;lunga ricerca&#8221; di vaccini a mRna: porta a una <strong><a href=\"https:\/\/www.nature.com\/articles\/nrd.2017.243\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">rassegna<\/a><\/strong>\u00a0di gennaio 2018. Riassume\u00a0<strong><a href=\"https:\/\/www.ncbi.nlm.nih.gov\/pmc\/articles\/PMC297778\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">trent&#8217;anni<\/a> <\/strong>di storia, quella recente soprattutto per superare i problemi tecnici legati a una produzione di massa.\u00a0E&#8217; in open access, come <strong><a href=\"https:\/\/www.ncbi.nlm.nih.gov\/pmc\/articles\/PMC3597572\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">quella del 2012<\/a><\/strong>\u00a0citata in bibliografia.<\/p>\n\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\"><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Non avevo mai visto un articolo di virologia con tante firme, ben 10 &#8220;corresponding authors&#8221; e altri membri di un paio di consorzi, nascosti nei materiali supplementari. Guardate qua, sembra quasi un paper di fisica delle particelle o di astrofisica delle onde gravitazionali!Per Science \u00e8 anche un paper insolitamente lungo. David Gordon (non corresponding author,&hellip; <a class=\"more-link\" href=\"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/2020\/12\/04\/approccio-collaborativo\/\">Continua a leggere <span class=\"screen-reader-text\">&quot;Approccio collaborativo&quot;<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[6,17],"tags":[862,870,2569,2573,4413,5586,6116,6118,7108],"class_list":["post-36141","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-biologia","category-genetica","tag-biochimica","tag-bioetica","tag-farmaci","tag-farmaci-riposizionati","tag-mers","tag-proteine","tag-sars","tag-sars-cov-2","tag-vaccini","entry"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/36141","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=36141"}],"version-history":[{"count":3,"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/36141\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":47094,"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/36141\/revisions\/47094"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=36141"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=36141"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=36141"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}