{"id":36186,"date":"2020-12-20T20:57:52","date_gmt":"2020-12-20T19:57:52","guid":{"rendered":"https:\/\/ocasapiens-dweb.blogautore.repubblica.it\/?p=36186"},"modified":"2022-04-24T17:30:14","modified_gmt":"2022-04-24T15:30:14","slug":"lignaggi","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/2020\/12\/20\/lignaggi\/","title":{"rendered":"Lignaggi"},"content":{"rendered":"

Fra amici e conoscenti, soprattutto se hanno figli che studiano o lavorano in Inghilterra, c’\u00e8 un po’ di ansia per il “nuovo ceppo” detto anche “variante inglese”, forse per via di articoli allarmanti. Domani ci sar\u00e0 la conferenza stampa dell’Organizzazione mondiale della Sanit\u00e0 (agg. 21\/12:<\/strong>\u00a0link al video<\/a><\/strong>, rif. anche il\u00a0briefing<\/a> <\/strong>di Independent Sage), intanto provo a riassumere quello che dicono ricercatori di cui mi di fido.<\/p>\n

Sono pacati, non fanno previsioni catastrofiche o rassicuranti in tv e nei giornali.
\nPremessa. I virus Sars-Cov-2 hanno accumulato mutazioni e varianti nei paesi dove sono isolati e sequenziati a ripetizione dall’inizio dell’anno. Le pi\u00f9 studiate, confrontate, modellizzate al computer per capirne gli effetti clinici sono quelle della proteina Spike – e rispettivo Rna – che il virus usa per attraversare la membrana della cellula, entrarci e riprodursi.<\/p>\n

Conviene anche dare un’occhiata al “nuovo ceppo” – si chiama 501.V2 – su Nextstrain<\/a>. <\/strong>Se cercate “ncov United Kingdom” o “ncov neherlab”,\u00a0in verde<\/strong><\/a> vedete le ultime varianti trovate in Inghilterra (il cerchietto rosso in basso a destra \u00e8 scozzese). E qui in giallo <\/a><\/strong>quelle del Sudafrica. I cladi sono indicati con l’anno e una lettera: 19A, 20A<\/a><\/strong>, 20B ecc.\u00a0Non<\/strong> vuol dire che sia iniziata una pandemia di covid-20. N\u00e9 vuol dire che i nuovi lignaggi isolati in Inghilterra, Danimarca, Paesi Bassi e Sudafrica siano pi\u00f9 pericolosi dei precedenti in termini di gravit\u00e0 e letalit\u00e0 del covid-19.<\/p>\n

In Sudafrica come in Inghilterra, sembrano diffondersi pi\u00f9 rapidamente e soprattutto fra i giovani. Come scrive Zweli Mkhidze<\/a><\/strong> del KRISP<\/a><\/strong>\u00a0all’universit\u00e0 del Kwazulu-Natal, la velocit\u00e0 dipende anche dalla densit\u00e0 degli abitanti e dai loro comportamenti – in particolare durante un periodo festivo.
\nMa allora i vaccini?<\/p>\n

Puntano tutti su quella maledetta proteina, \u00e8 vero. Ogni volta che il suo Rna muta o perde dei pezzi (delezione), hanno una probabilit\u00e0 di diventare meno efficaci. Per\u00f2 il vantaggio dei vaccini a mRna di Pfizer-BioNTech e Moderna, \u00e8 che si possono aggiornare subito mettendoci la sequenza cambiata. E creare cos\u00ec un altro vaccino da produrre in parallelo con quello destinato a paesi e regioni dove circolano varianti dalle mutazioni\/delezioni “neutre”.<\/p>\n

Servono soldi per differenziare la catena di produzione, insomma. Non sei mesi di tempo, come per aggiornare il vaccino anti-influenzale.<\/p>\n

Sul rischio delle nuove varianti, il\u00a0thread<\/a><\/strong>\u00a0di Trevor Bedford non \u00e8 molto tecnico. Refrain: bisognerebbe saperne di pi\u00f9. A questo scopo, auspica due interventi che richiedono un sistema sanitario efficiente, digitalizzato, centralizzato ecc.:<\/p>\n

\n
    \n
  1. le varianti emergenti dovrebbero essere testate <\/em>[assayed]\u00a0con il siero di individui guariti o vaccinati per identificare effetti antigenici ;<\/em><\/li>\n
  2. i registri di immunizzazione dovrebbero essere collegati alla sorveglianza genomica per identificare le varianti coinvolte nei focolai infettivi.\u00a0<\/em><\/li>\n<\/ol>\n<\/blockquote>\n

    Fran\u00e7ois Balloux va decisamente sul tecnico<\/a><\/strong>, d’altronde \u00e8 uno specialista dell’evoluzione virale. Fa alcune ipotesi per spiegare l’aumento della frequenza dei nuovi lignaggi (in Sudafrica, \u00e8 il pi\u00f9 diffuso nella popolazione). Sunto mio:<\/p>\n

    \n
      \n
    1. un “effetto del fondatore”, per es. un portatore contamina decine di altri durante un evento superspreading;<\/li>\n
    2. hanno acquisito entrambi mutazioni e delezioni che sommate li rendono pi\u00f9 trasmissibili, per es. aumentano la carica virale (gli sembra l’ipotesi pi\u00f9 plausibile, ma vorrebbe pi\u00f9 dati);<\/li>\n
    3. aggirano l’immunit\u00e0 conferita da altri ceppi o lignaggi. Se fosse cos\u00ec, non sarebbero pi\u00f9 contagiosi di per s\u00e9, ma troverebbero pi\u00f9 ospiti nel 10-20% della popolazione infettata in passato.<\/li>\n<\/ol>\n<\/blockquote>\n

      Nei dati inglesi<\/a><\/strong>, ci sono 4 reinfezioni “probabili” su circa 954 infezioni. Gli sembrano tante<\/a><\/strong>, ma andrebbero confrontate con il tasso di reinfezione di altri lignaggi…<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

      Fra amici e conoscenti, soprattutto se hanno figli che studiano o lavorano in Inghilterra, c’\u00e8 un po’ di ansia per il “nuovo ceppo” detto anche “variante inglese”, forse per via di articoli allarmanti. Domani ci sar\u00e0 la conferenza stampa dell’Organizzazione mondiale della Sanit\u00e0 (agg. 21\/12:\u00a0link al video, rif. anche il\u00a0briefing di Independent Sage), intanto provo… Continua a leggere Lignaggi<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[17,20],"tags":[2483,6118,7108],"class_list":["post-36186","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-genetica","category-medicina","tag-evoluzione","tag-sars-cov-2","tag-vaccini","entry"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/36186","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=36186"}],"version-history":[{"count":3,"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/36186\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":47136,"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/36186\/revisions\/47136"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=36186"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=36186"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/archivio.ocasapiens.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=36186"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}