Forza bruta

Su Nature Biotechnology, Ron Cheng e altri partecipanti al Resilience Project lanciato dalla fondazione Sage BioNetworks due anni fa, analizzano (e spesso ricontrollano in vitro) 12 data-set privati e pubblici di genomi, 400 mila dei quali appartengono a 23andMe:
A comprehensive screen of 874 genes in 589,306 genomes led to the identification of 13 adults harboring mutations for 8 severe Mendelian conditions, with no reported clinical manifestation of the indicated disease.
In quella montagna di sequenze, hanno cercato 874 geni che quando sono mutati causano 584 malattie genetiche – neurologiche, metaboliche ecc. – che si dichiarano nell’infanzia, e che non erano state diagnosticate nei donatori, arrivando così a soltanto 16 mila genomi. Il primo problema è che
more than 75% of the candidates were eliminated due to inaccurate or low-confidence variant calls in the existing data,
dice Stephen Friend, co-ideatore del Resilience Project, chissà come sarà contenta la CEO di 23andMe! Il secondo problema è ancora più frustrante:
none of the 13 final candidates could be contacted with follow-up questions due to limitations in the original studies’ informed consent policies. It will be impossible to determine whether these people are truly resistant to disease without additional information.
Che cosa li ha protetti? Risposta in un’altra puntata. Nel frattempo su Nature e altrove ci sono commenti pieni di promesse circa una via alternativa per la ricerca di terapie. Hmm… da un lato i 13 “super-eroigenetici sono stati “resilienti” fino al sequenziamento del loro genoma, dopo non si sa. Dall’altro sono 25 anni che si studiano i “long term survivors” infetti da HIV ma senza i sintomi dell’AIDS e le terapie sono tuttora gli anti-retrovirali.
Come quelli di ieri sul CRISPR-Cas9, mi sembra un risultato utile perché è in parte negativo e non solo perché dimostra quanto siano diventati potenti i sistemi di screening.
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Nel modello pubblicato su Nature Climate Change da Kristopher Karnauskas et al.:
By accounting for evaporative demand a posteriori at 80 island groups distributed among Earth’s major ocean basins we reveal a robust yet spatially variable tendency towards increasing aridity at over 73% of island groups (16?million people) by mid-century. 
Su 18 milioni di abitanti…
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Legge 194 e Consiglio d’Europa: trovo anch’io che la ministra Lorenzin sia un tantino disinformata.
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Il Guardian ha fatto analizzare 70 milioni di commenti sul suo sito, di cui 1,5 milioni bloccati. Spiegazione del metodo usato e commento:
New research into our own comment threads provides the first quantitative evidence for what female journalists have long suspected: that articles written by women attract more abuse and dismissive trolling than those written by men, regardless of what the article is about.
Although the majority of our regular opinion writers are white men, we found that those who experienced the highest levels of abuse and dismissive trolling were not. The 10 regular writers who got the most abuse were eight women (four white and four non-white) and two black men. (…)
And the 10 regular writers who got the least abuse? All men.

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Panama Papers
Fra i clienti di Mossack Fonseca, scrive il Süddeutschen Zeitung, parecchi trafficanti d’armi:
Due accusati nell’affare Iran-Contraun uomo ritenuto aiutare la CIA a consegnare armi in Afghanistan, ex alti responsabili de servizi segreti di Arabia Saudita, Colombia e Ruanda 
Link aggiunto.

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LOL  del giorno
Mats Lewan riprova a spiegare la causa intentata da Andrea Rossi  a Industrial Heat con uno scenario alternativo, ma
It’s really hard to say, at this point, what’s true and what’s fabricated information intended to serve someone’s interest. From all parts.
Che stia per scoprire la differenza tra giornalista e portavoce?

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